La prima concreta traccia storica dei Misteri la troviamo a Firenze: per le Sacre Rappresentazioni venivano usati gli ingegni, figurazioni viventi di Santi e angeli sostenute da impalcature in legno. Nel Quattrocento rimase celebre la serie dei Misteri del Paradiso di San Felice creati dal Brunelleschi e descritti dal Vasari.
Nel Cinquecento per la processione del Sacramento si usava trasportare su barelle gruppi di uomini atteggiati come martiri e santi. C'era anche la tradizione delle Faci, che nel Molise il popolo chiama tutt'ora faglie o n'torce. Queste faci erano costituite da un fusto di pioppo ricoperto di cera, e terminavano con un grosso lucignolo ardente. Altri tipi di face erano composti da varie candele lunghe di forma più o meno rettangolare che, unite, componevano un grosso cero. Il peso di queste faci poteva variare da una a quattro libbre o più.

Le faglie erano principalmente due: quella dei contadini e quella degli artigiani. La prima era circondata da muschio e spighe di frumento ancora verdi, la seconda era sostenuta da due angeli scolpiti in legno. Erano inoltre adornate da nastri e ghirlande, e il loro trasporto era sottolineato da accompagnamenti musicali specificatamente caratterizzati dal punto di vista timbrico: la faglia dei contadini era accompagnata da pifferi e zampogne, quella degli artigiani da violini. A Campobasso queste faglie, inizialmente poste all'ingresso della Confraternita del Corpus Domini in Sant'Antonio Abate, rappresentavano un'allegoria della luce diffusa dal Cristianesimo sulla Terra. Si conservavano nella chiesa di Sant'Antonio Abate, eretta da contadini e artigiani, e furono scolpite a bassorilievo sugli stipiti della porta principale della chiesa, datata 1572.

Per i Misteri ogni anno l'oggetto della rappresentazione cambiava su decisione degli organizzatori della festa: Spesso, però, il motivo profano prevaleva su quello religioso, e nel Consiglio Sinodale del 22 aprile 1639 il Vescovo di Boiano Fulgenzio Gallucci proibì i Misteri, con la motivazione che: rappresentationes quaedamque potius populum ad risum quam devotionem movere possunt, omnino tollentur. Pertanto dal 1629 dei Misteri non si parlerà più fino a quando Paolo Saverio Di Zinno ideerà i suoi ingegni o ingigni.